Alien Breed II: The Horror Continues tiene una jugabilidad influenciada
por Gauntlet, similar al original Alien Breed (y a la Edición Especial
'92), pero con muchas nuevas características. Como un soldado del
Cuerpo Interplanetario, debes visitar una remota colonia infestada de
alienígenas y destruir a los invasores alienígenas. El juego se divide
en 17 zonas, cada una con numerosos alienígenas diferentes. A medida
que vas avanzando a través del juego se recogen créditos, que pueden
ser objeto de comercio de armas, municiones y otras mejoras a través de
las computadoras en el juego. Las llaves se recogen a medida que
avanzas, y deben utilizarse sabiamente, ya que hay muchas habitaciones
que contienen bonus que no necesitan llave.